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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
29/01/2013 |
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Data da última atualização: |
22/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, Unesp; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURÍCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
SBMA 2012. |
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Conteúdo: |
A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001). |
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Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Genotipagem. |
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Thesagro: |
Bos Indicus. |
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Thesaurus Nal: |
Genotype; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism; Zebu. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75496/1/LUCIANA.pdf
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Marc: |
LEADER 02136nam a2200265 a 4500
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520 $aA identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).
650 $aGenotype
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700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
17/10/2016 |
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Data da última atualização: |
03/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 5 |
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Autoria: |
MELO, I. S. de; SOUZA, W. R.; SILVA, L. J.; SANTOS, S. N.; ASSALIN, M. R.; ZUCCHI, T. D.; QUEIROZ, S. C. do N. de. |
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Afiliação: |
ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; WALLACE RAFAEL DE SOUZA, FAJ; LEONARDO JOSE DA SILVA, ESALQ-USP; SUIKINAI NOBRE SANTOS, FAPESP; MARCIA REGINA ASSALIN, CNPMA; TIAGO DOMINGUES ZUCCHI; SONIA CLAUDIA DO N DE QUEIROZ, CNPMA. |
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Título: |
Antifungal activity of Pseudomonas frederiksbergensis CMAA 1323 isolated from the Antarctic hair grass Deschampsia antarctica. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
British Microbiology Research Journal, London, v. 14, n. 3, p. 1-11, 2016. Article n. BMRJ.25314. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Aims: Epiphytic bacteria, isolated from Deschampsia antarctica, were screened for their potential to inhibit the plant pathogen Botrytis cinerea, the causal agent of gray mold disease of strawberry pseudofruits. This phytopathogenic fungus is more active and the disease is more serious in temperate climate where the temperatures are lower. |
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Palavras-Chave: |
Compostos bioativos. |
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Thesagro: |
Bactéria; Botrytis cinerea; Controle biológico. |
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Thesaurus NAL: |
Antifungal agents; bioactive compounds; Deschampsia antarctica; diketopiperazines; Pseudomonas frederiksbergensis; psychrophilic bacteria. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148850/1/2016AP06.pdf
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Marc: |
LEADER 01371naa a2200313 a 4500
001 2054794
005 2017-03-03
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aMELO, I. S. de
245 $aAntifungal activity of Pseudomonas frederiksbergensis CMAA 1323 isolated from the Antarctic hair grass Deschampsia antarctica.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aAbstract: Aims: Epiphytic bacteria, isolated from Deschampsia antarctica, were screened for their potential to inhibit the plant pathogen Botrytis cinerea, the causal agent of gray mold disease of strawberry pseudofruits. This phytopathogenic fungus is more active and the disease is more serious in temperate climate where the temperatures are lower.
650 $aAntifungal agents
650 $abioactive compounds
650 $aDeschampsia antarctica
650 $adiketopiperazines
650 $aPseudomonas frederiksbergensis
650 $apsychrophilic bacteria
650 $aBactéria
650 $aBotrytis cinerea
650 $aControle biológico
653 $aCompostos bioativos
700 1 $aSOUZA, W. R.
700 1 $aSILVA, L. J.
700 1 $aSANTOS, S. N.
700 1 $aASSALIN, M. R.
700 1 $aZUCCHI, T. D.
700 1 $aQUEIROZ, S. C. do N. de
773 $tBritish Microbiology Research Journal, London$gv. 14, n. 3, p. 1-11, 2016. Article n. BMRJ.25314.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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